这个我很有发言权，因为本人本硕都是日本大学的，而且是两个不同专业（纯数学和计算科学）的。 简单说吧，本科的时候就是各种数学和计算机基础知识的学习和积累，课程包括实变函数、泛函分析、复变函数、微分方程、数值分析、算法设计、数据结构与程序设计等，除了计算方法和算法设计，其他基本都是打基础的学科基础课。
读研之后，方向不一样，所以上课内容就有差别了。我学的是计算科学，因此除了数理逻辑、抽象代数这些本科就学的课程外，还学习了很多新的知识，比如随机数学、统计推断、优化理论、机器学习、神经网络等等。虽然也学编程语言（R， C++），但是不深入，主要是了解编程的思想和方法就可以了。
当然啦，每个学校每个专业都有不一样的课程设置，不能概括全部。
农连垛优质答主在日本的大学里，一般都设有文学部、经济学部、法学部、理学部、工学部、教养学部、经营学部等。学部的设置是根据学生入学时所选择的专业来设定的。部下面设有学科，科下面又设有专业，这种体制使得学生的专业程度比较深入。另外，有些规模比较大的大学，下面还设有附属学校、研究所等。
日本大学的学部制度使学者的研究和教育的活动在同一个场所进行，学生能够接受最尖端的学问，对研究和教育都有非常正面的影响。而且各个大学的同名学部和学科，其设置的内容可以各自有其特点，这种自由度也能够培育多样化的人才。
除了学部制外，日本的大学中还有其他的学科制度。专科教育课程，只在都道府县所设置的短期大学中，在入学后2~3年的学习期限内完成规定课程的学习，其成绩合格者可取得专科（准学士）的学位资格。这是日本高等教育系统所规定的唯一的一段短期的高等教育。
